Las competencias de este profesional, le permitirán desempeñarse en empresas de agricultura protegida a nivel de producción o gerencial, despachos de asesoría o consultoría, programas gubernamentales y autoempleo.
El programa de la Maestría Interinstitucional se vincula de manera estrecha con el sector productivo en el área de Agricultura Protegida a través de sus profesores y estudiantes, quienes realizan en el cuarto semestre del programa una estancia en empresa. Por lo que se han vinculado a los estudiantes con empresas del sector productivo en Agricultura Protegida. Así mismo, profesores del programa han obtenido financiamiento de instituciones como CONACyT y la fundación Newton en combinación con el CECYTCOL para el desarrollo de proyectos que beneficien al sector productivo.