Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento (LGAC) planteadas para el programa son las siguientes:
a. Bioprospección.
b. Tecnología Biológica Vegetal Sostenible.
c. Interacción Planta y Medio Ambiente Biótico y Abiótico.
d. Biología Molecular y Celular.
e. Tecnología Biológica Ambiental Sostenible.